Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms