Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BRIP1Q9BX63 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRIP1Q9BX63 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BRIP1Q9BX63 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms