Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SYCP2Q9BX26 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SYCP2Q9BX26 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYCP2Q9BX26 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms