Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B5Q9BWJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms