Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CINPQ9BW66 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CINPQ9BW66 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CINPQ9BW66 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms