Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2Q9BVG9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms