Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM109Q9BVC6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.2 ms