Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KATNB1Q9BVA0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KATNB1Q9BVA0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms