Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TINF2Q9BSI4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TINF2Q9BSI4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TINF2Q9BSI4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TINF2Q9BSI4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TINF2Q9BSI4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TINF2Q9BSI4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TINF2Q9BSI4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TINF2Q9BSI4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TINF2Q9BSI4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TINF2Q9BSI4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TINF2Q9BSI4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms