Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLSTN3Q9BQT9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLSTN3Q9BQT9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms