Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL2Q99962 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL2Q99962 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms