Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP9Q99956 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP9Q99956 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms