Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL13Q99616 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL13Q99616 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL13Q99616 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms