Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT12Q99456 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT12Q99456 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms