Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YME1L1Q96TA2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YME1L1Q96TA2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YME1L1Q96TA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms