Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SIN3AQ96ST3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SIN3AQ96ST3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SIN3AQ96ST3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms