Protein–RNA interactions for Protein: Q96SI9

STRBP, Spermatid perinuclear RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRBPQ96SI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRBPQ96SI9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRBPQ96SI9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRBPQ96SI9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms