Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms