Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACCSQ96QU6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACCSQ96QU6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACCSQ96QU6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms