Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLIC6Q96NY7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIC6Q96NY7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms