Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF558Q96NG5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF558Q96NG5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms