Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C8orf49Q96NF6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf49Q96NF6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms