Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM227BQ96M60 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms