Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00477Q96M19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00477Q96M19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00477Q96M19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00477Q96M19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00477Q96M19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00477Q96M19 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00477Q96M19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00477Q96M19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00477Q96M19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00477Q96M19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00477Q96M19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00477Q96M19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms