Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC17Q96LX7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC17Q96LX7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC17Q96LX7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms