Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM47Q96LD4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM47Q96LD4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM47Q96LD4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms