Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD3Q96L08 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SUSD3Q96L08 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms