Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM8Q96KF7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM8Q96KF7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms