Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CABS1Q96KC9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CABS1Q96KC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms