Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLPTM1LQ96KA5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms