Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCHS1Q96JQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCHS1Q96JQ0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCHS1Q96JQ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms