Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMT2BQ96GJ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT2BQ96GJ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms