Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMP4Q96G21 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms