Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELP4Q96EB1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms