Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM5Q96DZ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM5Q96DZ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms