Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VWCEQ96DN2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWCEQ96DN2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWCEQ96DN2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms