Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF653Q96CK0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms