Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP4CQ96CF2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4CQ96CF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4CQ96CF2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms