Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MKL1Q969V6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MKL1Q969V6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms