Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOP1MTQ969P6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms