Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA10Q969M2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA10Q969M2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA10Q969M2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms