Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF34Q969K3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms