Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCE1Q969G3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCE1Q969G3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms