Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFRSF25Q93038 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms