Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRF1Q92994 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BRF1Q92994 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRF1Q92994 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms