Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PRG4Q92954 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRG4Q92954 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRG4Q92954 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms