Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD50Q92878 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD50Q92878 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD50Q92878 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD50Q92878 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD50Q92878 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD50Q92878 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD50Q92878 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD50Q92878 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD50Q92878 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD50Q92878 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD50Q92878 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD50Q92878 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD50Q92878 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD50Q92878 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD50Q92878 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD50Q92878 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD50Q92878 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD50Q92878 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RAD50Q92878 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD50Q92878 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD50Q92878 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD50Q92878 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD50Q92878 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD50Q92878 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD50Q92878 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD50Q92878 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD50Q92878 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD50Q92878 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RAD50Q92878 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD50Q92878 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD50Q92878 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD50Q92878 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD50Q92878 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RAD50Q92878 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD50Q92878 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD50Q92878 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAD50Q92878 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAD50Q92878 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms