Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRUQ92729 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRUQ92729 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRUQ92729 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms