Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF516Q92618 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF516Q92618 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF516Q92618 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF516Q92618 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF516Q92618 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms