Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBXN4Q92575 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN4Q92575 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms